한국석유공사는 국민권익위원회 주관 2013년 공공기관 청렴도 평가에서 공기업Ⅰ군중 1위, 전체 30개 공기업에서 3위를 차지했다.
중앙행정기관과 지방자치단체, 공직유관단체 등 총 653개 공공기관을 대상으로 실시된 청렴도 평가 결과, 공사는 공기업 전체 청렴도(8.31점)대비 0.3점 높은 8.61점으로서 인천국제공항공사 등 10개 Ⅰ군 공기업 중 1위, 30개 공기업에서는 전년도 12위에서 3위로 상승했다.
이에 대해 공사는 서문규 사장 취임 이후 공사가 지속적으로 추진해 온 투명경영 노력의 결실로, 신상필벌의 인사원칙 확립, 부패예방을 위한 신고제도 강화, 해외사업에 대한 내부통제 확대, 의식혁신을 위한 전 임직원 청렴교육 의무화 등 그간 전사적인 투명윤리경영 노력의 결과라고 설명했다.